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데이터 시각화의 세계: 다양한 자바스크립트 라이브러리

데이터 시각화란? 데이터 시각화는 데이터값을 정량화할 수 있는 속성으로 나타내 그래픽으로 표현한 결과물입니다. 이를 통해 복잡한 데이터를 숫자나 통계치보다 직관적으로 이해할 수 있으며, 추세, 패턴, 상관관계 등을 한눈에 파악할 수 있습니다. 이는 비즈니스 전략 수립이나 과학적 연구뿐 아니라, 다양한 분야에서 의사 결정을 내리거나 이해관계자들 간에 합의를 끌어내는 데 중요한 역할을 합니다. 데이터 시각화 예시 플로렌스 나이팅게일(Florence Nightingale)의 Rose Diagram은 데이터 시각화의 효과를 알 수 있는 좋은 사례입니다. 1850년대에 크림 전쟁 중에 군인 사망률은 계속 증가하고 있었습니다. 간호사뿐만 아니라 통계학자로 유명한 나이팅게일은 사망의 원인을 분석하고 문제를 해결하기 ..

2023. 12. 11.

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독도경비대를 괴롭혀 온 신종모기: 독도점등에모기

계절이 겨울로 접어들며, 여름내 밤잠을 설치게 했던 모기가 모습을 감추었습니다. 지난여름, 넘쳐나는 모기 때문에 많은 분이 피해를 받으셨을 거 같은데요. 모기가 왜 이렇게 많고 사람을 이렇게 괴롭히는지 저도 힘든 여름날을 보내었습니다. 사실 모기는 전 세계에 3,500여 종이 넘게 발견되었다고 합니다. 이렇게 다양한 모기들이 존재한다는 사실을 알고 계셨나요? 최근엔 독도에서 흔히 `깔따구`라고 불리는 흡혈성 곤충이 신종 모기라는 사실이 밝혀졌는데요. 이 모기는 독도에서 근무하고 있는 독도경비대원분들을 약 70년간 엄청나게 괴롭혔다고 합니다. 그 정체가 무엇인지 다 같이 알아보는 시간을 가져보겠습니다. 독도에 나타난 신종 모기 '독도점등에모기' "양말을 두 켤레, 세 켤레 신어도 뚫고 들어와요. 모기보다 ..

2023. 11. 28.

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인실리코젠 프로젝트 : 희귀질환 임상·유전체 관리시스템 구축(대한민국에 어린왕자가 산다!)

대한민국에 어린 왕자가 한 명 살고 있습니다. 어린 왕자라니 무슨 말인지 의아하실 텐데요. 그 주인공은 바로 올해 18살의 홍원기 군입니다. 제가 홍원기 군을 알게 된 건 저의 최애 프로그램 중 하나인 ‘인간극장’을 통해서입니다. 홍원기 군은 2015년에 ‘우리 집에 어린 왕자가 산다’편을 통해 방송에 알려지게 됐습니다. 원기 군이 어린 왕자라고 불리는 이유는 어린 나이에 80세 노인의 신체 노화를 겪고 있는 소아조로증 환자이기 때문이에요. 소아조로증(Progeria Syndrome)은 어린아이들에게 조기 노화현상이 나타나는 희귀한 유전 질환인데요. 조로증은 유전자 LMNA(Lamin A)의 돌연변이에 의해 생기며, Lamin A에 결함이 생기면 핵이 불안정하게 되고 노화현상이 일어나게 됩니다. 조로증에..

2023. 11. 13.

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이게 몇개로 보이나요: 물체가 두개로 보이는 복시

위에 보이는 그림을 보고 어떤 생각이 들었나요? "물체가 흔들리네"라고 생각하거나 "물체가 두 개인가"라고 생각하셨을 겁니다. 그렇지만 누군가에게는 항상 바라보는 모든 세상이 이렇게 보이는 사람도 있습니다. 제 주변에도 많은 분이 복시로 답답함을 느끼며 살아가시는 분들이 있기에 정보를 더 자세히 공유해보려고 합니다. 다룰 내용은 복시란 무엇인가, 복시의 종류 중에서도 양안복시에 대해서 더 자세히 알아보려 합니다. 복시는 원인에 따라 다르지만, 최대한 빨리 교정을 통해서 호전될 수 있다고 해요. 이 글을 읽고 혹시나 하시는 분은 빠른 조치를 통해 호전되셨으면 좋겠습니다. 복시란 무엇인가? 복시란, 망막 점에 한 물체 상이 동시에 인지되었을 때 나타나는 현상으로 두 개의 같은 물체가 존재하는 것처럼 느끼는 ..

2023. 11. 6.

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애플워치를 능가하는 바디워치: 내 몸 안의 생체시계와 시차증후군

추석처럼 긴 연휴나 연말이면 해외여행을 많이 가곤 합니다. 저도 몇 년 전 연휴를 활용해 해외여행을 떠난 적이 있는데요! 행복한 시간을 기대하며 긴 시간 비행기를 탔던 기억이 납니다. 하지만 목적지에 도착했을 때 가장 먼저 저를 반겨준 건 시차증후군으로 인한 피로감이었습니다. 보통 먼 곳에 가기 위해 장거리 비행을 하게 되면 여러 시간대를 통과하게 됩니다. 그리고 목적지에 도착하면 많은 사람이 시차증후군을 겪습니다. 단순히 생각해보면, 단지 해가 뜨고 지는 시간이 달라졌을 뿐인데 왜 이런 증상이 발생하는 걸까 싶습니다. 우리 몸에 시계라도 있어서 이런 일이 일어나는 걸까 싶은데요, 사실 우리 몸에 시계가 있는 것이 맞습니다. 지구에 사는 생명체 대부분은 생체시계를 갖고 있습니다. 우리가 사는 지구는 하루..

2023. 10. 30.

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[LabStory] 서울대학교 이주훈 교수님 편

랩스토리 어느덧 4번째 이야기! 올해 초에 랩스토리를 시작한 게 엊그제 같은데 벌써 4번째 랩스토리라니~ 시간이 정말 빠르다는 것을 새삼 실감합니다. 건강을 위해서는 수면, 식단, 운동이 필수인데요, 그중에서도 음식을 섭취할 때 발효음식을 잘 챙겨 먹어야 합니다. 그 이유는 음식의 발효 과정에서 증식하는 유산균이 건강에 이롭기 때문이에요. 예를 들면 장에 서식하는 비피더스균은 소화 흡수 작용을 도우며, 콩을 발효할 때 증식되는 바실러스균은 항암과 항당뇨 효과가 있습니다. 더불어 이런 유산균 등이 소화가 잘되도록 재료들을 어느 정도 분해해 놓기 때문에 우리 몸에 흡수가 더 용이하다고 합니다. 4번째 랩스토리에서는 이러한 발효음식, 발효유의 연구와 함께 마이크로바이옴 연구의 선두 주자이신 서울대 이주훈 교수..

2023. 10. 16.

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19번째 생일을 맞이한 인실리코젠

안녕하세요. 여러분~ 생물정보 전문기업 (주)인실리코젠입니다. 10월 1일은 인실리코젠의 창립기념일입니다. 어느덧 인실리코젠이 19번째 생일을 맞이했습니다! 곧 있으면 20주년이 되는데 매우 기대가 됩니다. 😊 19주년 행사는 20주년을 맞이하기 전 쉬어가는 마음으로 다소 간소하게 치러졌습니다. 19주년 창립기념식은 2023년 인코덤 결산 및 시상, 근속상 수여식, 사장님 기념사 후 점심 식사 순으로 진행되었습니다. 먼저 MD 협의회 5기로 활동 중인 5기 MD분들의 인코덤 한 해 결산을 영상으로 담아보았습니다. 인코덤 홈페이지를 리뉴얼하고 콘텐츠 작성 가이드를 재정비하는 등 인코덤 발전에 많은 심혈을 기울인 한해였습니다. 수고 많으셨어요~! 인코덤 운영진 MD 협의회 영상 다음으로는 인코덤 시상이 있었..

2023. 10. 6.

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전국의 육종 데이터를 하나로, 데이터 육종 플랫폼 ibreeder를 소개합니다!

아이브리더(ibreeder)란? 아이브리더(ibreeder)는 작물의 유전자원, 표현형 그리고 유전형을 관리하기 위한 웹 기반 디지털 육종 플랫폼입니다. 기존에 육종가들이 야장(field note)이라는 것에 일일이 손으로 기록하는 번거로움을 보완하고 종자산업 경쟁력 확보를 위해 설계 및 구축된 시스템입니다. [그림.1]은 아이브리더의 메인화면입니다. 다양한 기능이 있으며 이 중 2023년 한국육종학회에서 주목받았던 메뉴들을 소개하고자 합니다. (한국육종학회 참가 후기: 2023 한국육종학회에 참가한 인실리코젠) 아이브리더는 프로젝트(과제)를 기준으로 야장 데이터를 수집하고 관리할 수 있습니다. 더 나아가 인공지능과 기계학습을 통해 효과적 작물 재배와 육종이 가능하도록 준비하고 있습니다. 모든 데이터를 ..

2023. 10. 4.

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[LabStory] 세종대학교 신학동 교수님 편

두둥! 3번째 LabStory를 시작합니다! 고대 그리스의 철학가이자 의사인 히포크라테스는 무려 2,400여 년 전 “모든 질병은 장에서 비롯된다”라고 말했습니다. 장은 소화, 흡수, 배출 등 기본적인 역할을 담당하는 것 외에도, 눈에는 보이지 않지만, 셀 수 없는 다양한 종류의 미생물이 생태계를 이루고 있습니다. 이것을 장내 마이크로바이옴이라고 하는데, 우리 몸에 살고 있는 미생물의 숫자는 100조가 넘는다고 합니다. 이전 LabStory에서는 주로 동물 유전 현상을 연구하시는 교수님들을 인터뷰했다면 이번에는 인간의 장내 마이크로바이옴을 연구하는 분을 찾아갔습니다. 아침저녁으로 시원한 바람이 부는 8월 막바지의 어느 날 만난 세종대학교 신학동 교수님 이야기입니다. Introducing the Profe..

2023. 9. 4.

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나만 알고 싶은 OmicsBox

`유전체 데이터는 점차 쌓여가고···쌓여가는 데이터 처리는 해야겠고···이왕 처리하는 거 효율적으로, 내가 원하는 방향으로 처리하고 싶은데···심도 있는 분석은 또 어떻게 진행해야 하는 걸까···` 이런 의문 품어보신 적 다들 있으시죠?! 있을 겁니다! 저 또한 그랬으니까요! 제 경우에는 OmicsBox라는 솔루션이 저의 이러한 의문을 해소해주었습니다. 제가 OmicsBox를 처음 접한 건 바야흐로 대학원 시절. 그 당시에는 OmicsBox로 리뉴얼 되기 전인 Blast2GO 버전이었습니다. 저는 그 당시 De Novo Transcriptome 분석을 진행했었고, BLAST 분석 이후의 후속 분석인 Functional Analysis(GO, KEGG, InterProScan)를 Blast2GO를 이용하여..

2023. 8. 9.