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NGS 데이터 분석을 위한 솔루션 : CLC Genomics Workbench

💡생물학 연구자가 CLC Genomics Workbench를 사용해야 하는 6가지 이유 1. 누구라도 쉽게 사용할 수 있는 사용자 친화적인 인터페이스 2. SIMD 기술을 적용한 초고속 NGS 데이터 분석 3. NGS 응용 연구 분야 분석 수행 4. 다양한 NGS 포맷 지원 (Sanger, Illumina, Ion Torrent, Helicos, PacBio, Roche 등) 5. CLC Main Workbench의 기능을 포함한 솔루션 6. 추가적인 프리미엄 모듈을 통한 metagenome 등의 분석 확장 DNA의 염기서열에는 생물의 형질을 포함하는 다양한 유전적 정보가 저장되어있습니다. 따라서, 염기서열을 분석하는 것은 다양한 생물학적 현상을 밝혀내는 데에 중요하게 작용합니다. 최근 Illumina,..

2022. 8. 9.

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HTML에서 실행하는 Python과 PyScript

PyScript란? Python은 현재 수많은 라이브러리와 오픈 소스를 통해 데이터 분석과 시각화 및 머신러닝, 딥러닝과 같이 인공지능 분야에서 활발하게 활동 중인 프로그래밍 언어 중 하나입니다. 그렇다 보니 python은 back-end 서비스에 더욱 최적화되어있다고 볼 수 있습니다. 추가로 Python의 특징인 쉽고 빠르다는 장점을 통해 data scientist, researcher, developer 등 다양한 직종에서 활용되고 있는 프로그래밍 언어입니다. "이렇게 훌륭한 프로그래밍 언어를 Browser에서 사용할 수 있다면 얼마나 좋을까?"라는 말은 꽤 오래전부터 나오던 이야기였는데 올해 PyCon 2022 conference에서 Anaconda가 많은 사람의 염원을 이루어줄 PyScript를 ..

2022. 7. 25.

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인실리코젠 프로젝트 : 한우가 당신의 식탁에 오르기까지, 소도체 기계화 품질평가 시스템

남녀노소 어른이나 아이 할 것 없이 즐겨 먹는 소고기! 미국에는 앵거스 비프, 일본에는 와규가 있다면, 한국에는 한우가 있어요. 한우는 세계에서 가장 오래된 한국 고유의 소품종으로 맛과 품질이 뛰어나 특별한 행사가 있거나 손님을 대접할 때는 꼭 한우를 먹게 되는데요. (맛으로 따지면 한우가 최고죠!) 2021년 3월에는 USA 투데이라는 미국의 일간지에서는 '한우가 지구상의 최고의 고기인 이유'라는 제목의 글을 실어, 한우의 위상은 더욱 높아졌는데요! 기사에서는 홍콩의 유명 셰프의 말을 인용하며 한우는 미국 스테이크처럼 기름기가 적고 와규만큼 기름진 것도 아닌 적절한 지방과 단백질의 배합으로 부드러우면서도 식감이 살아 있다고 전했습니다. 소고기의 풍미와 부드러움을 결정짓는 요소는 단백질과 지방의 비율이 ..

2022. 7. 11.

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질병 바이오마커 후보 발굴을 위한 빅데이터 활용 생물정보 분석 플랫폼

바이오마커는 DNA, RNA, 대사 물질, 단백질 및 단백질 조각 등에서 유래된 분자적 정보로써 질병의 발생 등으로 유발된 신체의 변화를 감지할 수 있는 지표로 정의되어 있습니다. 질병의 발생 및 진행, 치료 방법에 대한 약물 반응성을 객관적으로 측정하고 평가할 수 있어 질병의 조기 발견 및 예후 관찰, 개인별 맞춤 의료 기술 등 폭넓게 이용되고 있으며 1990년대 이후 오믹스 기술의 보급으로 바이오마커 개발 연구가 급증하였습니다. 질병은 결함이 있는 단백질 하나가 아닌 여러 개 이상의 단백질이 복합적으로 관련되어 있을 수 있으므로 유전자 발현(전사체: Transcriptome) 정보를 활용하여 특정 질환과 관련된 세포, 조직에서의 특정 유전자 발현 패턴 변화를 분석하고 정상 세포, 조직의 패턴으로 전환..

2022. 6. 27.

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인실리코젠 프로젝트 : 실종아동 찾기

세상에는 많은 이별이 있습니다. 연인과의 이별, 사랑하는 반려견과의 이별, 친구와의 이별... 가끔 유튜브의 알고리즘에 의해 강아지들이 무지개다리를 건너고 주인들이 슬퍼하는 영상을 보게 되는데요... 어느샌가 따라 울고 있는 저 자신과 마주하곤 합니다...😢 모든 이별은 가슴 아프지만 가장 가슴 아픈 이별은 가족이, 그중에서도 자녀가 실종되어 생사도 모르는 경우가 아닐까요? 지하철이나 거리를 걷다 보면 “실종자를 찾습니다” 같은 전단을 종종 보곤 합니다. 또, 도로에서 자주 보았던 “실종된 OOO를 찾아주세요” 현수막을 보면 안타까울 때가 많았던 것 같습니다. 21년 4월 말 기준으로 장기 실종아동의 수는 840명이며, 이 가운데 20년이 넘었지만 찾지 못한 경우는 663명으로 전체의 78.9%입니다. ..

2022. 5. 16.

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COVID-19와 임상시험

중국 후베이성 우한시에서 처음 확인된 SARS-CoV-2의 감염증인 COVID-19는 2019년 12월 전 세계 최초로 발생하였으며, 2020년 1월 19일 중국 우한시에서 국내에 입국한 중국 국적의 35세 여성(중국 우한시 거주)이 국내 최초로 확진되었습니다. 이후 세계보건기구는 2020년 1월에 국제적 공중보건 비상사태를 선언하였고, 3월에는 팬데믹 즉 세계적 범유행으로 격상시켰습니다. 이후 2년여간 전 세계는 COVID-19와의 치열한 싸움을 지속하였고 현재도 그 싸움은 끝나지 않고 진행형입니다. 최초 팬데믹 이후 감염병 전문가들은 팬데믹을 막을 수 있는 유일한 무기로 백신을 꼽았으며, 이러한 백신을 개발하기 위한 많은 노력과 비용을 치르게 되었습니다. 그 결과 2020년 12월 18일, 미국 식품..

2022. 5. 2.

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디지털 전환(Digital Transformation)과 바이오 빅데이터

2021년 코로나19(COVID-19) 팬데믹으로 인해 사회, 비즈니스뿐만 아니라 개인에게서까지 디지털 전환(Digital Transformation)이 가속화되고 있습니다. 현재 정부가 주도하고 있는 ‘디지털 뉴딜’과 함께 데이터를 활용할 수 있는 범위는 한층 더 넓어졌으며, 정부에서도 이를 바탕으로 데이터 기반 행정을 본격적으로 추진해 나가고 있습니다. 디지털 전환(Digital Transformation) 현재를 이끄는 전 세계적인 추세인 디지털 전환이란 무엇일까요? 디지털 전환(Digital Transformation)이란 디지털 기술을 사회 전반에 적용하여 전통적인 사회 구조를 혁신시키는 것으로 기업에서 사물 인터넷(IoT), 클라우드 컴퓨팅, 인공지능(AI), 빅데이터 솔루션 등 정보통신기술(..

2022. 3. 29.

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[Promotion] 슬기로운 연구생활 제3탄

CLC Genomics Workbench & Premium 연간 구독형 라이선스 공식 런칭 이벤트 CLC 솔루션의 permanent 버전이 단종되고 연간 구독형 라이선스 형태로 정책이 변경 되었습니다. 프로모션 기간 내 홈페이지를 통한 견적 요청 후, 구매 확정 또는 구매를 해주시는 분들께 CLC Main Workbench를 무료로 증정해 드립니다. 이벤트 참가방법 안내 CLC Main Workbench 무료로 받는 방법! 1. 인실리코젠 홈페이지 회원가입 및 로그인 2. 제품/서비스 상세소개 페이지 방문 CLC Genomics Workbench Next Generation Sequencing 데이터의 유전체 및 전사체 분석을 위한 GUI 기반의 통합 솔루션 바로가기 CLC Genomics Workben..

2022. 3. 10.

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인실리코젠 프로젝트 : 소중한 반려견 질병 예방하기!

저희 인실리코젠 본사 근처 광교호수공원을 걷다 보면 강아지와 산책하는 분들을 정말 자주 마주칠 수 있는데요. 그만큼 강아지를 키우시는 분들이 매우 많은 것 같아요. (TMI : 저 역시 갓 1살이 된 푸들 아가를 키우고 있답니다!) KB경영연구소가 발표한 2021 한국 반려동물 보고서에 따르면 우리나라에 반려견을 키우는 인구는 약 1,448만 명이며, 가구는 604만 가구로 전체 가구의 29.7%, 반려견의 숫자도 586만 마리에 달한다고 합니다. 친구이기도 하고 가족이기도 한 나의 소중한 반려견과 오래오래 함께하고 싶은 마음은 강아지를 키우고 계신 분들이라면 다들 공감하실 텐데요! 반려견들은 교배되는 과정에서 순종의 종(breed)을 선호하는 경향성 때문에 근친 교배가 이루어졌고 이에 따라 유전병이 빈..

2022. 3. 7.

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Tiger or Cat in bioinformatics

조선시대에는 정초가 되면 호랑이 그림을 곳곳에 붙였다고 합니다. 호랑이의 용감무쌍함에 기대 화재(火災), 수재(水災), 풍재(風災)의 삼재로부터 보호받고자 했답니다. 또한 호랑이는 병난(兵難), 질병, 기근의 세 가지 고통으로부터 인간을 지켜주는 힘을 가졌다고 믿었습니다. 2022년 임인년, 검은 호랑이의 해를 맞이하여 지긋지긋한 코로나19 상황이 끝나고 곧 일상이 회복될 것 같은 설렘은 호랑이와 우리 사이에 바로 이와 같은 서사가 존재하기 때문이 아닐까 합니다. #귀여움이세상을구한다 #새해복많이받으세호 #당신은호랑이의행운을받았습니다 트렌드 코리아는 2022년 키워드를 "TIGER OR CAT"으로 제시하며 승자독식과 새로운 양극화의 상황에서 고양이처럼 울다 그칠 것인지, 아니면 검은 호랑이처럼 힘차게 ..

2021. 12. 29.