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STORAGE

식물과 미생물의 생존 본능, 지그재그 모델

식물은 외부 환경과 계속 노출되어 있지만 움직일 수 없습니다. 이런 상태에서 자신에게 접근하는 다양한 요인들을 판단해서 병원체의 경우에는 막아야 합니다. 기본적으로 큐티클층, 세포벽, 항균 물질 등 다양한 방어 체계를 가지고 있습니다. 하지만 이들이 뚫리게 되어 감염이 발생하고, 감염된 상황을 성공적으로 대처하지 못했다면 어떨까요? 식물체는 병들고 곧 죽게 될 것입니다. 예시 중 하나로 최근 몇 년간 딸기 농가를 괴롭힌 딸기 시들음병이 있습니다. 작년에만 대략 1,000억 원의 피해가 발생했다고 예측되었는데요, 이 병은 고온 환경과 함께 Fusarium oxysporum 이라는 토양성 곰팡이가 작은 곤충 등에 의해 딸기 뿌리에 생긴 상처를 통해 감염 증상을 일으킵니다. 하지만 식물의 입장에서 모든 요인을..

2022. 10. 31.

LIFE

인실리코젠 창립 제18주년 기념식

안녕하세요~! 인실리코젠이 벌써 창립 18주년을 맞이하였습니다. 창립기념일은 10월 1일이라 항상 날씨가 청명하고 가을의 정취를 느낄 수 있는 것 같아 좋은 것 같습니다. 한해 한해 성장해 나가는 회사의 모습을 보니 매우 뿌듯하고 자랑스러운 마음까지 듭니다. 최남우 사장님께서 올해의 슬로건을 바이오 빅데이터의 리더로 정해주셨는데요. 우보천리(牛步千里) 마보십리(牛步千里)라는 말처럼 천천히 우직하고 꾸준하게 생물정보 분야의 길을 걸어 나가는 인실리코젠이 되어야 하겠습니다. 이번에도 비대면으로 온라인 기념식을 진행하였는데요, 그 현장 속으로 함께 가보시죠~! 18주년 장기근속자 먼저 장기근속자에 대한 시상이 있었습니다. 평생직장이라는 개념이 사라진 요즘 시대에 열심히 한자리에서 묵묵히 5년, 10년 장기근속..

2022. 10. 20.

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음악의 뇌과학

여러분은 음악을 좋아하시나요? 우리가 살아가는 일상에서 음악이라고 하는 예술은 쉽게 찾아볼 수가 있습니다. 이러한 음악이 우리의 뇌에 많은 영향을 끼친다는 사실 알고 계셨나요? 사람들이 게임이나 도박, 맛있는 음식 등에서 쾌락을 느끼는 것과 관련된 뇌 화학물질이 음악을 들을 때도 작용하며 뇌의 양쪽 반구를 활성화하고, 그들 사이에 새로운 연결을 만든다고 합니다. 이러한 이유로 음악을 통해 즐겁고 슬픈 감정을 느낄 수 있고, 시간을 통해 여행할 수 있게 해주며, 때로는 힘을 얻기도 하는 것입니다. 음악이 뇌에 미치는 영향 우리는 신나는 음악 혹은 좋아하는 음악을 듣게 되면 즐거움이라는 감정을 느끼게 됩니다. 그럼 음악을 들었을 때 뇌에서는 어떤 반응이 일어나는지 한 번 알아보겠습니다. 연구에 따르면, 뇌에..

2022. 10. 11.

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개와 늑대의 시간(L'heure entre chien et loup) : 유전자로 보는 개와 늑대 차이

개와 늑대의 시간은 해 질 녘에 프랑스 양치기들 사이에서 유래된 프랑스어 표현으로 저 언덕 너머로 다가오는 실루엣이 내가 기르던 개인지, 나를 해치러 오는 늑대인지 분간하기 어려운 시간대를 나타냅니다. 그렇다면, 해 질 녘에 실루엣만 보고 개인지, 늑대인지 분간하는 게 왜 어려웠을까요? 정답은, 개와 늑대가 같은 생물 종(種, species)이기 때문입니다. 하지만 늑대는 개와 다르게 인간에게 전혀 다르게 다가오는 동물입니다. 개는 인간에게 도움을 주며 주변에 위협을 막아내지만, 늑대는 가축과 인간의 생명을 위협하는 존재이기 때문이죠. 이처럼 같은 생물 종이면서 전혀 다른 존재가 되어 버린 두 동물 사이에는 어떤 시간이 있었고 어떤 유전적 차이들이 있었던 것일까요? 개와 늑대와의 관계 현 분류학 기준에 ..

2022. 8. 29.

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이기적 유전자 : 유전자를 통해 새롭게 보는 세상

과학 분야의 대표적 스테디셀러 중 하나인 『이기적 유전자』는 1976년 초판(원서 기준)이 발행된 영국의 생물학자 리처드 도킨스의 대표작입니다. 다윈의 진화론을 근간으로 유전자 단위의 진화를 학술적 제시가 아닌 대중을 대상으로 비교적 쉽게 쓴 책으로, 이후 개정판(1989)과 30주년 기념판(2006)을 지나, 현재는 40주년 기념판(2016)이 발행되었습니다. 이처럼 긴 세월의 검증을 거치며 세계적인 관심과 그 가치를 인정받았으며, 진화생물학의 새로운 패러다임을 제시했다고 평가되고 있습니다. 과학계의 고전이라 불리며 40여 년간 꾸준히 사랑받고 있는, 진화생물학의 필독 교양서 『이기적 유전자』를 소개합니다. 『이기적 유전자』는 크게 세 개의 문단으로 나누어서 설명할 수 있습니다. 모든 생물은 유전자로 ..

2022. 8. 16.

NEWS

NGS 데이터 분석을 위한 솔루션 : CLC Genomics Workbench

💡생물학 연구자가 CLC Genomics Workbench를 사용해야 하는 6가지 이유 1. 누구라도 쉽게 사용할 수 있는 사용자 친화적인 인터페이스 2. SIMD 기술을 적용한 초고속 NGS 데이터 분석 3. NGS 응용 연구 분야 분석 수행 4. 다양한 NGS 포맷 지원 (Sanger, Illumina, Ion Torrent, Helicos, PacBio, Roche 등) 5. CLC Main Workbench의 기능을 포함한 솔루션 6. 추가적인 프리미엄 모듈을 통한 metagenome 등의 분석 확장 DNA의 염기서열에는 생물의 형질을 포함하는 다양한 유전적 정보가 저장되어있습니다. 따라서, 염기서열을 분석하는 것은 다양한 생물학적 현상을 밝혀내는 데에 중요하게 작용합니다. 최근 Illumina,..

2022. 8. 9.

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HTML에서 실행하는 Python과 PyScript

PyScript란? Python은 현재 수많은 라이브러리와 오픈 소스를 통해 데이터 분석과 시각화 및 머신러닝, 딥러닝과 같이 인공지능 분야에서 활발하게 활동 중인 프로그래밍 언어 중 하나입니다. 그렇다 보니 python은 back-end 서비스에 더욱 최적화되어있다고 볼 수 있습니다. 추가로 Python의 특징인 쉽고 빠르다는 장점을 통해 data scientist, researcher, developer 등 다양한 직종에서 활용되고 있는 프로그래밍 언어입니다. "이렇게 훌륭한 프로그래밍 언어를 Browser에서 사용할 수 있다면 얼마나 좋을까?"라는 말은 꽤 오래전부터 나오던 이야기였는데 올해 PyCon 2022 conference에서 Anaconda가 많은 사람의 염원을 이루어줄 PyScript를 ..

2022. 7. 25.

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인실리코젠 프로젝트 : 한우가 당신의 식탁에 오르기까지, 소도체 기계화 품질평가 시스템

남녀노소 어른이나 아이 할 것 없이 즐겨 먹는 소고기! 미국에는 앵거스 비프, 일본에는 와규가 있다면, 한국에는 한우가 있어요. 한우는 세계에서 가장 오래된 한국 고유의 소품종으로 맛과 품질이 뛰어나 특별한 행사가 있거나 손님을 대접할 때는 꼭 한우를 먹게 되는데요. (맛으로 따지면 한우가 최고죠!) 2021년 3월에는 USA 투데이라는 미국의 일간지에서는 '한우가 지구상의 최고의 고기인 이유'라는 제목의 글을 실어, 한우의 위상은 더욱 높아졌는데요! 기사에서는 홍콩의 유명 셰프의 말을 인용하며 한우는 미국 스테이크처럼 기름기가 적고 와규만큼 기름진 것도 아닌 적절한 지방과 단백질의 배합으로 부드러우면서도 식감이 살아 있다고 전했습니다. 소고기의 풍미와 부드러움을 결정짓는 요소는 단백질과 지방의 비율이 ..

2022. 7. 11.

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질병 바이오마커 후보 발굴을 위한 빅데이터 활용 생물정보 분석 플랫폼

바이오마커는 DNA, RNA, 대사 물질, 단백질 및 단백질 조각 등에서 유래된 분자적 정보로써 질병의 발생 등으로 유발된 신체의 변화를 감지할 수 있는 지표로 정의되어 있습니다. 질병의 발생 및 진행, 치료 방법에 대한 약물 반응성을 객관적으로 측정하고 평가할 수 있어 질병의 조기 발견 및 예후 관찰, 개인별 맞춤 의료 기술 등 폭넓게 이용되고 있으며 1990년대 이후 오믹스 기술의 보급으로 바이오마커 개발 연구가 급증하였습니다. 질병은 결함이 있는 단백질 하나가 아닌 여러 개 이상의 단백질이 복합적으로 관련되어 있을 수 있으므로 유전자 발현(전사체: Transcriptome) 정보를 활용하여 특정 질환과 관련된 세포, 조직에서의 특정 유전자 발현 패턴 변화를 분석하고 정상 세포, 조직의 패턴으로 전환..

2022. 6. 27.

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인실리코젠 프로젝트 : 실종아동 찾기

세상에는 많은 이별이 있습니다. 연인과의 이별, 사랑하는 반려견과의 이별, 친구와의 이별... 가끔 유튜브의 알고리즘에 의해 강아지들이 무지개다리를 건너고 주인들이 슬퍼하는 영상을 보게 되는데요... 어느샌가 따라 울고 있는 저 자신과 마주하곤 합니다...😢 모든 이별은 가슴 아프지만 가장 가슴 아픈 이별은 가족이, 그중에서도 자녀가 실종되어 생사도 모르는 경우가 아닐까요? 지하철이나 거리를 걷다 보면 “실종자를 찾습니다” 같은 전단을 종종 보곤 합니다. 또, 도로에서 자주 보았던 “실종된 OOO를 찾아주세요” 현수막을 보면 안타까울 때가 많았던 것 같습니다. 21년 4월 말 기준으로 장기 실종아동의 수는 840명이며, 이 가운데 20년이 넘었지만 찾지 못한 경우는 663명으로 전체의 78.9%입니다. ..

2022. 5. 16.