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인실리코젠 프로젝트 : 남북 이산가족 찾기

세계 유일의 분단국가인 대한민국. 1950년 6월 25일 발발한 한국전쟁 이후로 남과 북에 따로 떨어져 생사조차 알지 못하고 있는 가족과 친지들이 있는데요. 이들을 일컬어 이산가족이라고 합니다. 떨어진 가족을 만나지 못하는 그 아픔을 생각하면 매우 안타까운 일이 아닐 수가 없습니다. 남북 이산가족 상봉은 1971년 8월 12일에 대한민국의 대한적십자사가 실시한 “이산가족 찾기 운동”을 계기로 시작되었습니다. 그리고 마침내 대한민국과 북한의 합의에 따라 1985년 9월, 서울과 평양에서 최초로 이산가족 고향방문단과 예술공연 교환 행사가 이루어졌습니다. 그 후, 2000년 남북정상회담을 계기로 2000년 8월 15일에 1차 이산가족 상봉을 시작으로 2018년에는 21차까지 이산가족 상봉이 이루어졌습니다. 이..

2022. 12. 26.

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비정형 유기체적 형상의 디자인 분야 활용

조형에 관한 연구는 시대 변천에 따라 끊임없이 변화하며 여러 가지 형식으로 발전해 왔는데요, 이는 단순히 조형을 소비하는 각 시대 사람들의 주관적인 취향 문제가 아니라 미적 취향과 관련된 우리 사회의 다양한 대내외적 요인에 영향을 받아 현재까지도 변화하고 있는 것입니다. 이러한 관점에서 디자인 분야는 앞으로 어떠한 조형미를 갖춘 디자인을 도출할 것인지와 어떻게 형태를 구현해 낼 것인지는 중요한 문제입니다. 현재, 기술 변화에 대응하는 새로운 조형 방식의 탐구가 활발하게 이루어지고 있습니다. 오늘 블로그는 여러 형태적 특성 중 비정형(Atypical)과 유기체(Organism)라는 특성을 가지고 산업디자인 분야를 비롯한 인실리코젠의 디자인과 연관 지어 설명해보도록 하겠습니다. 비정형(Atypical)이란?..

2022. 12. 12.

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NGS 데이터 파일 형식 및 파일 형식 검증툴 소개

NGS 데이터는 처리하는 과정에서 다양한 형식의 파일이 생성됩니다. 그리고 각각의 분석 과정에서 지정된 데이터 포맷의 파일만 입력 파일로 활용할 수 있고 분석 결과는 지정된 포맷의 파일이 생성됩니다. 예를 들면 위의 분석 과정 중 alignment to genome 단계에서 자주 사용되는 bwa 이라는 분석 툴은 FASTQ 형식 파일을 입력 파일로 받아서 SAM 형식의 결과 파일을 출력합니다. 이렇게 분석 단계별로 입출력 파일 형식이 지정되어 있습니다. 대용량의 NGS 데이터를 분석하다 보면 예기치 못한 오류메시지를 보게 되는 경우가 종종 있습니다. 이런 때 의외로 데이터 파일 포맷이 올바르지 않아 프로그램에서 인식할 수 없다는 로그를 종종 보게 됩니다. 원인은 다양합니다. 우선 연구자가 임의로 만든 파..

2022. 11. 28.

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공공 SW 사업 제안요청서 변천 과정

제안요청서란? 공공 SW 사업을 수주하기 위해서, 제안자는 나라장터에 공공기관이 올려놓은 제안요청서를 확인하고 이에 대한 제안서를 작성하는 것으로 시작합니다. 제안요청서(RFP, request for proposal)는 발주자가 특정 사업의 수행에 필요한 요구사항을 체계적으로 정리하여 제시함으로써 제안자가 제안서를 작성하는데 도움을 주기 위한 문서입니다. 이런 제안요청서에는 해당 사업의 제목, 목적 및 목표, 내용, 기대성과, 수행 기간, 금액(Budget), 참가 자격, 제출서류 목록, 요구사항, 제안서 목차, 평가 기준 등의 내용이 포함되어 있습니다. 제안자는 이렇게 올라온 제안요청서를 숙지하여 이를 바탕으로 제안서를 작성하게 되는데, 제안요청서 내용이 구체적이거나 명확하지 않으면 제안서를 작성하기가..

2022. 11. 15.

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식물과 미생물의 생존 본능, 지그재그 모델

식물은 외부 환경과 계속 노출되어 있지만 움직일 수 없습니다. 이런 상태에서 자신에게 접근하는 다양한 요인들을 판단해서 병원체의 경우에는 막아야 합니다. 기본적으로 큐티클층, 세포벽, 항균 물질 등 다양한 방어 체계를 가지고 있습니다. 하지만 이들이 뚫리게 되어 감염이 발생하고, 감염된 상황을 성공적으로 대처하지 못했다면 어떨까요? 식물체는 병들고 곧 죽게 될 것입니다. 예시 중 하나로 최근 몇 년간 딸기 농가를 괴롭힌 딸기 시들음병이 있습니다. 작년에만 대략 1,000억 원의 피해가 발생했다고 예측되었는데요, 이 병은 고온 환경과 함께 Fusarium oxysporum 이라는 토양성 곰팡이가 작은 곤충 등에 의해 딸기 뿌리에 생긴 상처를 통해 감염 증상을 일으킵니다. 하지만 식물의 입장에서 모든 요인을..

2022. 10. 31.

LIFE

인실리코젠 창립 제18주년 기념식

안녕하세요~! 인실리코젠이 벌써 창립 18주년을 맞이하였습니다. 창립기념일은 10월 1일이라 항상 날씨가 청명하고 가을의 정취를 느낄 수 있는 것 같아 좋은 것 같습니다. 한해 한해 성장해 나가는 회사의 모습을 보니 매우 뿌듯하고 자랑스러운 마음까지 듭니다. 최남우 사장님께서 올해의 슬로건을 바이오 빅데이터의 리더로 정해주셨는데요. 우보천리(牛步千里) 마보십리(牛步千里)라는 말처럼 천천히 우직하고 꾸준하게 생물정보 분야의 길을 걸어 나가는 인실리코젠이 되어야 하겠습니다. 이번에도 비대면으로 온라인 기념식을 진행하였는데요, 그 현장 속으로 함께 가보시죠~! 18주년 장기근속자 먼저 장기근속자에 대한 시상이 있었습니다. 평생직장이라는 개념이 사라진 요즘 시대에 열심히 한자리에서 묵묵히 5년, 10년 장기근속..

2022. 10. 20.

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음악의 뇌과학

여러분은 음악을 좋아하시나요? 우리가 살아가는 일상에서 음악이라고 하는 예술은 쉽게 찾아볼 수가 있습니다. 이러한 음악이 우리의 뇌에 많은 영향을 끼친다는 사실 알고 계셨나요? 사람들이 게임이나 도박, 맛있는 음식 등에서 쾌락을 느끼는 것과 관련된 뇌 화학물질이 음악을 들을 때도 작용하며 뇌의 양쪽 반구를 활성화하고, 그들 사이에 새로운 연결을 만든다고 합니다. 이러한 이유로 음악을 통해 즐겁고 슬픈 감정을 느낄 수 있고, 시간을 통해 여행할 수 있게 해주며, 때로는 힘을 얻기도 하는 것입니다. 음악이 뇌에 미치는 영향 우리는 신나는 음악 혹은 좋아하는 음악을 듣게 되면 즐거움이라는 감정을 느끼게 됩니다. 그럼 음악을 들었을 때 뇌에서는 어떤 반응이 일어나는지 한 번 알아보겠습니다. 연구에 따르면, 뇌에..

2022. 10. 11.

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개와 늑대의 시간(L'heure entre chien et loup) : 유전자로 보는 개와 늑대 차이

개와 늑대의 시간은 해 질 녘에 프랑스 양치기들 사이에서 유래된 프랑스어 표현으로 저 언덕 너머로 다가오는 실루엣이 내가 기르던 개인지, 나를 해치러 오는 늑대인지 분간하기 어려운 시간대를 나타냅니다. 그렇다면, 해 질 녘에 실루엣만 보고 개인지, 늑대인지 분간하는 게 왜 어려웠을까요? 정답은, 개와 늑대가 같은 생물 종(種, species)이기 때문입니다. 하지만 늑대는 개와 다르게 인간에게 전혀 다르게 다가오는 동물입니다. 개는 인간에게 도움을 주며 주변에 위협을 막아내지만, 늑대는 가축과 인간의 생명을 위협하는 존재이기 때문이죠. 이처럼 같은 생물 종이면서 전혀 다른 존재가 되어 버린 두 동물 사이에는 어떤 시간이 있었고 어떤 유전적 차이들이 있었던 것일까요? 개와 늑대와의 관계 현 분류학 기준에 ..

2022. 8. 29.

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이기적 유전자 : 유전자를 통해 새롭게 보는 세상

과학 분야의 대표적 스테디셀러 중 하나인 『이기적 유전자』는 1976년 초판(원서 기준)이 발행된 영국의 생물학자 리처드 도킨스의 대표작입니다. 다윈의 진화론을 근간으로 유전자 단위의 진화를 학술적 제시가 아닌 대중을 대상으로 비교적 쉽게 쓴 책으로, 이후 개정판(1989)과 30주년 기념판(2006)을 지나, 현재는 40주년 기념판(2016)이 발행되었습니다. 이처럼 긴 세월의 검증을 거치며 세계적인 관심과 그 가치를 인정받았으며, 진화생물학의 새로운 패러다임을 제시했다고 평가되고 있습니다. 과학계의 고전이라 불리며 40여 년간 꾸준히 사랑받고 있는, 진화생물학의 필독 교양서 『이기적 유전자』를 소개합니다. 『이기적 유전자』는 크게 세 개의 문단으로 나누어서 설명할 수 있습니다. 모든 생물은 유전자로 ..

2022. 8. 16.

NEWS

NGS 데이터 분석을 위한 솔루션 : CLC Genomics Workbench

💡생물학 연구자가 CLC Genomics Workbench를 사용해야 하는 6가지 이유 1. 누구라도 쉽게 사용할 수 있는 사용자 친화적인 인터페이스 2. SIMD 기술을 적용한 초고속 NGS 데이터 분석 3. NGS 응용 연구 분야 분석 수행 4. 다양한 NGS 포맷 지원 (Sanger, Illumina, Ion Torrent, Helicos, PacBio, Roche 등) 5. CLC Main Workbench의 기능을 포함한 솔루션 6. 추가적인 프리미엄 모듈을 통한 metagenome 등의 분석 확장 DNA의 염기서열에는 생물의 형질을 포함하는 다양한 유전적 정보가 저장되어있습니다. 따라서, 염기서열을 분석하는 것은 다양한 생물학적 현상을 밝혀내는 데에 중요하게 작용합니다. 최근 Illumina,..

2022. 8. 9.